不同的認證有不同的審核標準和不同的審核程序，就拿ISO系列的認證標準來說，就有很大的區別。
ISO14000認證審核與ISO9000認證審核有何異同ISO9000系列標準是保證產品的質量，ISO14000系列標準則是要求組織承諾遵守環境法律法規及其他要求，并對污染預防和持續改進做出承諾。
ISO14000系列標準與ISO9000系列標準有什么異同ISO9000系列標準已被全世界80多個國家和區域的組織所采用，為廣大組織提供了質量管理和質量保證體系認證方面的要素、導則的要求。ISO14000系列標準是對組織的活動、產品和服務從原材料的選擇、設計、加工、銷售、運輸、使用到最終廢棄物的處置進行全過程的管理，二者共同之處有：
1、ISO14000與ISO9000具有共同的實施對象：
在各類組織建立科學、規范和程序化的管理系統。
2、兩套標準的管理體系相似：
ISO14000某些標準的框架、結構和內容參考了ISO9000中的某些標準規定的框架、結構和內容。
但這兩個標準在內涵和承諾對象上不同，主要表現在：
1）、承諾對象不同：
ISO9000標準的承諾對象是產品的使用者、消費者，它是按不同消費者的需要，以合同形式進行體現的。而ISO14000系列標準則是向相關方的承諾，受益者將是全社會，是人類的生存環境的人類自身的共同需要，這無法通過合同體現，只能通過利益相關方，其中主要是政府來代表社會的需要，用法律、法規來體現，所以ISO14000的最低要求是達到政府規定的環境法律、法規與其他要求。
2）、承諾的內容不同：
ISO9000系列標準是保證產品的質量；而ISO14000系列標準則是要求組織承諾遵守環境法律、法規及其他要求，并對污染預防和持續改進做出承諾。
3）、體系的構成模式不同：
ISO9000質量管理模式是封閉的，而環境管理體系則是螺旋上升的開環模式。要求體系不斷地有所改進和提高。
4）、審核認證的依據不同：
ISO9000標準是質量管理體系認證的根本依據；而環境管理體系認證除符合ISO14001外，還必須結合本國的環境法律、法規及相關標準，如果組織的環境行為不能滿足國家要求，則難以通過體系的認證。
5）、對審核人員資格的要求不同：
ISO14000系列標準涉及的是環境問題，面對的是如何按照本國的環境法律、法規、標準等要求保護生態環境，污染防治和處理的具體環境問題，故環境管理體系對組織有目標、指標的要求，因而從事ISO14000認證工作的人員必須具備響應的環境知識的環境管理經驗，否則難以對現場存在的環境問題做出正確判斷。
將不同的認證區別看待，就會對這種認證加深認識。
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